Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxf1Q61080 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxf1Q61080 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms