Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms