Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms