Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf8Q60846 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms