Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

Predictions only

Length 3,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelnQ60841 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelnQ60841 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelnQ60841 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelnQ60841 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelnQ60841 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RelnQ60841 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RelnQ60841 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RelnQ60841 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RelnQ60841 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RelnQ60841 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RelnQ60841 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RelnQ60841 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RelnQ60841 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelnQ60841 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelnQ60841 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelnQ60841 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelnQ60841 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelnQ60841 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelnQ60841 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelnQ60841 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelnQ60841 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelnQ60841 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelnQ60841 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelnQ60841 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms