Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms