Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms