Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms