Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms