Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms