Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms