Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

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Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf123Q5XPI3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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