Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc125Q5U465 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc125Q5U465 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc125Q5U465 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc125Q5U465 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc125Q5U465 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc125Q5U465 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc125Q5U465 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc125Q5U465 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms