Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdcp1Q5U462 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdcp1Q5U462 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdcp1Q5U462 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdcp1Q5U462 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdcp1Q5U462 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdcp1Q5U462 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdcp1Q5U462 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdcp1Q5U462 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdcp1Q5U462 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdcp1Q5U462 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdcp1Q5U462 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdcp1Q5U462 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdcp1Q5U462 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdcp1Q5U462 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdcp1Q5U462 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdcp1Q5U462 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms