Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim38Q5SZ99 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim38Q5SZ99 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim38Q5SZ99 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim38Q5SZ99 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim38Q5SZ99 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim38Q5SZ99 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim38Q5SZ99 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim38Q5SZ99 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Trim38Q5SZ99 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim38Q5SZ99 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim38Q5SZ99 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Trim38Q5SZ99 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Trim38Q5SZ99 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Trim38Q5SZ99 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Trim38Q5SZ99 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim38Q5SZ99 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim38Q5SZ99 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim38Q5SZ99 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Trim38Q5SZ99 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Trim38Q5SZ99 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Trim38Q5SZ99 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Trim38Q5SZ99 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Trim38Q5SZ99 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim38Q5SZ99 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Trim38Q5SZ99 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim38Q5SZ99 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim38Q5SZ99 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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Trim38Q5SZ99 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
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