Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms