Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myh1Q5SX40 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myh1Q5SX40 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myh1Q5SX40 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myh1Q5SX40 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myh1Q5SX40 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Myh1Q5SX40 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms