Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX39

Myh4, Myosin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,939 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh4Q5SX39 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Myh4Q5SX39 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Myh4Q5SX39 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myh4Q5SX39 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myh4Q5SX39 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myh4Q5SX39 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myh4Q5SX39 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myh4Q5SX39 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myh4Q5SX39 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myh4Q5SX39 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myh4Q5SX39 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Myh4Q5SX39 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Myh4Q5SX39 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms