Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms