Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NacadQ5SWP3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NacadQ5SWP3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NacadQ5SWP3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NacadQ5SWP3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NacadQ5SWP3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NacadQ5SWP3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NacadQ5SWP3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NacadQ5SWP3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
NacadQ5SWP3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NacadQ5SWP3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NacadQ5SWP3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NacadQ5SWP3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NacadQ5SWP3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NacadQ5SWP3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NacadQ5SWP3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
NacadQ5SWP3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NacadQ5SWP3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
NacadQ5SWP3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NacadQ5SWP3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NacadQ5SWP3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NacadQ5SWP3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NacadQ5SWP3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NacadQ5SWP3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NacadQ5SWP3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NacadQ5SWP3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NacadQ5SWP3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
NacadQ5SWP3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC34■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NacadQ5SWP3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms