Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW46

Lpo, Lactoperoxidase, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LpoQ5SW46 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LpoQ5SW46 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LpoQ5SW46 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LpoQ5SW46 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
LpoQ5SW46 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LpoQ5SW46 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LpoQ5SW46 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LpoQ5SW46 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LpoQ5SW46 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LpoQ5SW46 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms