Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms