Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam71bQ5STT6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms