Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms