Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms