Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQY2

Bod1, Biorientation of chromosomes in cell division protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bod1Q5SQY2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms