Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf215Q5SPX3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf215Q5SPX3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf215Q5SPX3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf215Q5SPX3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms