Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms