Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms