Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtp3Q5QGU6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rtp3Q5QGU6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rtp3Q5QGU6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtp3Q5QGU6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtp3Q5QGU6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms