Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm6bQ5NCY0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Kdm6bQ5NCY0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kdm6bQ5NCY0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kdm6bQ5NCY0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Kdm6bQ5NCY0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Kdm6bQ5NCY0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm6bQ5NCY0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm6bQ5NCY0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms