Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms