Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm12253Q5NC48 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm12253Q5NC48 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm12253Q5NC48 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm12253Q5NC48 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm12253Q5NC48 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm12253Q5NC48 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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