Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms