Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpm3Q5F4S9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms