Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms