Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syce1lQ5D525 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms