Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms