Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prune2Q52KR3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prune2Q52KR3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prune2Q52KR3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prune2Q52KR3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prune2Q52KR3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prune2Q52KR3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prune2Q52KR3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prune2Q52KR3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prune2Q52KR3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prune2Q52KR3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prune2Q52KR3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prune2Q52KR3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prune2Q52KR3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prune2Q52KR3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prune2Q52KR3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms