Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms