Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnl1Q52KE7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms