Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shank3Q4ACU6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms