Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms