Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Fam220aQ3ZN08 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Fam220aQ3ZN08 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Fam220aQ3ZN08 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Fam220aQ3ZN08 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Fam220aQ3ZN08 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Fam220aQ3ZN08 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Fam220aQ3ZN08 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Fam220aQ3ZN08 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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