Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms