Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms