Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Kdm5aQ3UXZ9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kdm5aQ3UXZ9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kdm5aQ3UXZ9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kdm5aQ3UXZ9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5aQ3UXZ9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5aQ3UXZ9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5aQ3UXZ9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5aQ3UXZ9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5aQ3UXZ9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5aQ3UXZ9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms