Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms