Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU96

Cdc42bpa, Serine/threonine-protein kinase MRCK alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpaQ3UU96 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdc42bpaQ3UU96 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdc42bpaQ3UU96 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdc42bpaQ3UU96 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdc42bpaQ3UU96 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdc42bpaQ3UU96 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdc42bpaQ3UU96 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdc42bpaQ3UU96 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdc42bpaQ3UU96 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Cdc42bpaQ3UU96 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdc42bpaQ3UU96 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdc42bpaQ3UU96 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdc42bpaQ3UU96 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms