Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Fchsd2Q3USJ8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms